当前位置:首页>亲子游戏>正文

双尾检测相关性不显著

2.2 中性绘图分析

芒果叶绿体基因组GC12的芒果密码取值范围在0.33~0.56之间,GC3的叶绿因组取值范围在0.18~0.32之间,基因全部落在中线对角线上方(图1)。体基GC12与GC3的使用相关系数0.279(表2),双尾检测相关性不显著,偏好回归系数(曲线斜率)为0.3544,性分析相关性较弱。芒果密码结合图1和表2表明芒果叶绿体基因组密码子第1、叶绿因组2位和第3位碱基之间关联性不大,体基自然选择在芒果叶绿体基因组密码子偏好使用中起主要作用。使用

2.3 ENC-plot绘图分析

ENC-plot绘图以ENC比值[(预期ENC值~实际ENC值)/预期ENC值]和ENC比值频数判断偏好性影响因素,偏好揭示ENC与GC3s的性分析关系,反映碱基组对密码子偏好性的芒果密码影响程度。基因坐标点离标准曲线的叶绿因组距离近且数量较多说明偏好性主要受到突变的影响;反之说明偏好性受选择的影响较大。图2结合表3显示60%共33个基因分布在–0.05~0.05之间,体基这33个基因的实际ENC值与预期ENC值接近,与标准曲线的距离较近,分布在–0.05~0.05之外的基因有22个,这22个基因与预期ENC值较远,在标准曲线较远的位置。说明芒果基因组密码子偏好性与GC3的差异有关,突变对芒果叶绿体基因组密码子偏好性的影响较大。

2.4 PR2-plot绘图分析

PR2-plot绘图通过分析密码子第3位碱基的组成关系,揭示密码子使用偏好性的影响因素。由图3可以看出芒果基因在4个区域内分布不均匀,多数分布于平面图的左下方。T和C在密码子第3位出现的频率较高,G与C、A与T的使用频率不相等,T的使用频率高于A,C的使用频率高于G,嘧啶的使用频率高于嘌呤,说明突变不是影响芒果密码子使用偏好性的唯一因素,选择等其他因素对芒果密码子使用偏好性也产生一定的影响。

 


2.5 相对同义密码子使用度分析

利用codonW软件对芒果55条基因序列的RSCU值进行计算(表4)。结果显示RSCU>1的密码子共31个,出现频率相对较高的是以A(13个)或T(16个)结尾的密码子,是芒果基因组偏爱;以G(1个)或C(1个)结尾的密码子出现的频率较低且RSCU值多小于1,说明这些是基因组非偏好的密码子。
 

相关链接:芒果基因组嘧啶嘌呤

 


声明:本文所用图片、文字来源《热带作物学报》,版权归原作者所有。如涉及作品内容、版权等问题,请与本网联系

热门标签
友情链接:
调光玻璃的原理是什么 调光玻璃都有什么尺寸的,行业资讯东北地区玻璃市场报价整体上涨,行业资讯玻璃磨边流程!,玻璃技术成都“双流造”玻璃 建筑物上建“发电站”,行业资讯备孕期间的饮食选择:毛蟹是否适宜及合理搭配区域陆续召开会议,厂家调价提振市场,行业资讯砖瓦和农业生产体系玻璃是硅酸盐产品么 什么是硅酸盐产品,行业资讯中空玻璃材料有哪些功能 提升中空玻璃质量的方法,行业资讯使用钢化玻璃的注意事项 中空玻璃制作流程及注意事项,行业资讯饮水机与净水器认识的误区美国拟制订进口棕榈油中嘧菌酯的最大残留限量高效液相色谱法同时测定鱼腥草芩蓝合剂中7种成分(一)罗望子种仁球蛋白结构和功能特性的构效关系(三)福建做好五项市场监管工作 打赢疫情防控阻击战玻璃排气的分类,经验交流咸宁南玻玻璃有限公司被认定为绿色工厂,企业经营国家药监局:对新型肺炎疫情防控所需药械实行应急审批5G网络技术发展需求给3D曲面玻璃迎来发展机遇,企业新闻国家药监局应急审批新型冠状病毒核酸检测试剂幕墙设计对建筑外立面设计的影响分析,经验交流菲律宾拟制订含有反式脂肪酸的加工预包装食品指南2019年11月11日中国玻璃综合指数,产业数据进价5角卖5元 湖南常德查获120万只问题口罩“百姓点检日”走进农贸市场龙眼新品种(系)引种南宁的果实发育和品质变化规律比较(三)曹德旺:民营企业家的问题是德不配位,出现问题的主要根源是贪婪,企业新闻价格调整开始,观望情绪渐浓,期货知识一测多评法测定羊肚菌中17种氨基酸的含量(二)山西老陈醋优良芽孢菌与醋酸菌、乳酸菌的相互作用(二)泰国制订干香菇农业标准顶格处罚!南昌一超市供货商被罚20万元新疆市场监管部门约谈相关企业 加强医用商品市场价格监管印度对进口肉桂中香豆素展开检验工信部:2019年度要点用能行业能效“领跑者”遴选工作正式开展!,行业会议北京石景山区市场监管局为企业登记注册开通绿色通道不同防腐剂对烤制鱿鱼片贮藏品质的影响(一)假冒伪劣、篡改日期、哄抬物价…上海曝光十大“口罩”违法典型案例技能筑梦 山西举办全省计量职业技能比赛薄层色谱法鉴别槐枝及高效液相色谱法测定其中芦丁含量(二)立案查处74件 江西南昌通报10起疫情防控期间违法典型案例